El Colegio Alpamayo ocupa una extensión de cinco hectáreas a la altura de la cuadra 70 de la avenida Javier Prado Este, en la urbanización Mayorazgo.

Todas sus aulas y laboratorios están equipados con sistemas multimedia y acceso a internet.  Cuenta con modernos laboratorios de física, química, biología y de cómputo.  Biblioteca. Salas de arte y música (5 en total). Auditorio. Capilla. Circuito neuromotor.
En sus instalaciones deportivas tiene piscina temperada de 25 m x 6 carriles, dos canchas de fútbol de pasto natural y de rugby, canchas de basket, pista atlética de tierra batida y camerinos apropiados.

Los alumnos pueden hacer uso del amplio y agradable ambiente de comedor donde personal especializado prepara una dieta especial balanceada teniendo en cuenta las características del consumo de calorías y necesidades nutritivas de los varones en sus distintas edades.  (El costo del comedor no está incluido en la pensión y es de elección libre por los padres).